针对我国严峻的环境污染和生态安全问题，瞄准国家重大需求和污染环境修复与生态健康学科前沿，充分发挥农业资源与环境、环境科学与工程国家重点学科群的综合优势，本实验室以改善环境质量、保障生态健康为目标，重点开展农业环境化学(重金属、有机污染物、碳氮磷)污染过程、诊断、控制与修复的应用基础创新研究，建成具有国际先进水平的农业环境污染修复与生态健康领域的理论和技术创新平台、学科交叉的高水平人才集聚和培养基地、国内外学术交流与合作中心。本实验室在解决国家和区域重大环境问题、开展多学科交叉的创新性应用基础和关键技术研究、推动资源与环境学科发展、***资源环境类人才培养等方面发挥了突出的作用，为国家和地方的生态环境保护、社会经济可持续发展提供前瞻性的理论基础、技术支撑和人才储备。
实验室主要有四个研究方向
1 、环境污染过程：主要研究持久性有机污染物、重金属、碳氮磷等、水生态系统中化学与生物学过程的机理及调控技术。在土壤有机污染多界面过程机理、流域氮磷面源污染过程模拟与定量控制等方面研究形成明显优势。
2 、生态健康诊断与预警：主要研究污染物与生物的相互作用及生态毒理;污染环境质量退化机制与生态健康诊断原理与方法。在土壤农药污染健康效应与风险预警、土壤重金属污染食物链诊断技术与指标等方面取得创新性理论与实用技术成果。
3 、污染控制与资源化：主要研究环境污染控制与资源化原理及技术，农业农村废物资源化循环利用与污染源头削减等。在大气面源污染控制、有机固液废物资源化利用与污染削减、农田养分减排等方面取得创新成果，形成优势。
4 、污染环境生态修复：主要研究植物-微生物对污染物特异吸收与积累的基因型差异及其生理与分子生理基础;污染土壤生物修复原理与技术;水体富营养化的生态修复原理与工程技术等。在水体富营养化生态净化原理与技术、土壤重金属植物修复机理与技术、有机污染土壤和场地修复技术方面取得创新进展，形成特色优势。
