山东省农业科学院农业资源与环境研究所始建于1949年，前身是山东省农业实验所农艺化学系，1959年4月改称山东省农业科学院土壤肥料研究所，2010年12月更名为山东省农业科学院农业资源与环境研究所。下设植物营养与肥料、肥料创制、土壤与水、微生物与生物技术、沼气科学、农业环境工程、农业生态安全、精准农业技术8 个研究室和分析测试室、寿光实验站，以及办公室、科研管理办公室和财务室3个行政管理机构。建有农业部黄淮海平原农业环境重点实验室等3个国家级平台，山东省植物营养与肥料重点实验室等3个省级平台和山东邦地生物科技有限责任公司实体单位。
经过60多年的建设与发展，形成了植物营养与肥料创制、资源循环利用与环境保护、微生物资源挖掘与利用三大重点优势学科，培优了植物营养与施肥、新型肥料研制、食用菌遗传育种与栽培、农业面源污染防控、沼气科学及农村环境保护、土壤保育与节水、食用菌产后加工7个研究方向。拥有全省三大土类(棕壤、褐土、潮土)池栽长期定位试验基地(自1982年始)，肥料中试基地2500平方米，科研示范基地8处。固定资产1292万元。现有在职职工62名，其中科研人员58名，科研辅助人员4名。科研人员中研究员14名，副研究员13名，博士18名、硕士16名，享受国务院政府特贴1名，山东省有突出贡献的中青年专家2名，山东省泰山学者特聘专家1名，济南专业技术拔尖人才1名。
近年来，承担国家 973计划、国家863计划、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、国家星火计划、农业部产业技术体系、农业公益性行业科研专项、国际科技合作及省内项目 80余项。自1978年全国科学大会以来，共获科技成果80余项，其中国家技术发明二等奖2项，国家科技进步二等奖4项(合作)，教育部科技进步一等奖1 项(合作)，农业部科技进步二等奖1项、三等奖2项，山东省技术发明一等奖1项，省科技进步一等奖1项、二等奖17项。共有5个食用菌品种通过了国家和省审(认)定。获国家发明专利103项，实用新型专利34项。制定农业行业标准3项，山东省地方标准39项。编辑出版著作50余部，发表学术论文2000余篇。先后与加拿大、俄罗斯、澳大利亚、德国、美国、日本、韩国、乌克兰等十几个国家建立了密切的合作关系。被评为“十一五”全国农业科研机构百强所、 2012年度省直文明单位和全院先进集体。目前，全所职工在机遇与挑战并存的态势下，创新思维，以思求变，同心协力，横向联动，清正廉洁，为全省乃至黄淮海地区资源节约型、环境友好型社会建设和单位发展发挥聪明才智。
